植物原位雜交除了在遺傳育種方面的應用，還在其他領域有著廣泛的應用，包括：
植物基因研究：植物基因是一種利用基因工程技術來人類遺傳疾病的方法。通過植物原位雜交技術，可以將人類基因導入到植物細胞中，并在植物細胞中表達出相應的蛋白質，為基因提供重要的物質基礎。
植物抗性研究：植物原位雜交技術可以用于研究植物對環境脅迫的抗性機制，熒光原位雜交，例如抗旱、抗鹽、抗病等，有助于了解植物在環境脅迫下的生理和分子響應機制。
植物比較研究：通過植物原位雜交技術可以比較不同植物之間基因表達模式的差異，從而為植物分類和進化研究提供重要的參考依據。



 
 
預雜交
1）每個管中置換成大約300ulHYB－溶液，60℃水浴5分鐘，避免振蕩。
2）用等體積的HYB＋取代HYB－。
3）60℃水浴，預雜交4小時以上。
雜交
1）吸去預雜交的HYB＋，加上100ul已加入探針的HYB＋溶液（探針濃度約為1ng/ul）..
2）60℃ 溫浴過夜。
注：雜交與預雜交的溫度可以是55到60度不等，溫度越低，探針結合越好，溫度越高，背景越小。




原位雜交技術是在一定的溫度和離子濃度下，使具有特異序列的單鏈探針通過堿基互補規則與組織細胞內待測的核酸復性結合而使得組織細胞中的特異性核酸得到定位，并通過探針上所標記的檢測系統將其在核酸的原有位置上顯示出來。經特定標記的核苷酸鏈為探針，可與組織切片、細胞或染色體標本中的待檢DNA片段或mRNA進行雜交，然后顯示標記物，從而分析待檢核酸的分布和含量。利用此項技術可研究各種基因在染色體上的定位，編碼某種蛋白質的mRNA在胞質中的表達。



 
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