目前，魚菜共生行業中對于“魚”的選擇中比較成功的大概是：羅非魚、鯉魚、鯽魚、草魚、寶石鱸魚、池塘淤泥、加州鱸魚、澳洲淡水石斑魚等，而觀賞魚可以喂養錦鯉、斗魚、金魚等。另外還有南美對蝦，在魚菜共生模式有不少的成功案例，畢竟南美對蝦的價格還是不錯的。
魚菜共生系統中的菜，魚菜共生技術，它只是作物附屬的產品存在，原因上面也簡單說了，大體就是這個意思。而對于這個菜的種植方式而言，基本以無土栽培模式。其中也就是水培模式或者基質栽培模式，主要是利用魚糞給蔬菜種植的養分供給。



 
魚菜共生是一種涉及魚類與植物的營養生理、環境、理化等學科的生態型可持續發展農業新技術，就是在魚類養殖池塘種植蔬菜，利用魚類與蔬菜的共生互補，池塘水面進行蔬菜無土栽培，將漁業和種植業有機結合，進行池塘魚菜生態系統內物質循環，互惠互利。詳見下圖。池塘魚菜共生生態養殖具有凈水，降低池塘水體富營養化；光合作用增氧；遮陰避暑；提高水產量；賣菜增收；減少水電藥等成本投入；防盜；抑菌；景觀工程等優勢。


魚菜共生的技術原理就是自然界物質循環的方式之一（圖1），即以水為媒介，建立水產養殖動物與植物，植物與微生物以及微生物與微生物之間的互利共生機制，
以促進微生物對養殖有機廢棄物的礦化分解和植物對營養物質的吸收利用，從而實現“養魚不換水而無水質憂患，種菜不施肥而正常成長”的生態共生效應。
魚菜共生系統中，隨著魚類排泄物和飼料殘渣的增多，異養微生物（包含氨化菌）首先開始繁殖，有機廢物被分解并礦化為小分子營養物質，為自養菌（包含硝化細菌）的繁殖提供了條件。其中，有機物質當中的含氮物質經氨化作用轉化為氨氮（NH3-N），在硝化細菌的作用下，NH3-N被氧化為NO2-N，并進一步被氧化為NO3-N，致使NH3-N以及NO2-N含量逐漸下降并趨于零，而NO3-N含量逐漸上升。此時，微生物的代謝旺盛，系統對有機物質的凈化能力強。故NO3-N的出現是系統微生態開始建立的主要標志。養殖有機廢棄物在微生物的作用下被逐級礦化，繼而成為養分被植物根系吸收，從而實現對養殖水體的凈化。



 
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